Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otud1Q9CUB6 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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