Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Il24-201ENSMUST00000121040 1159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm15570-201ENSMUST00000122093 625 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 1700028P15Rik-203ENSMUST00000151904 519 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm23563-201ENSMUST00000174900 251 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm24368-201ENSMUST00000175388 106 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm4398-201ENSMUST00000182698 992 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm43833-201ENSMUST00000198828 293 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm39348-201ENSMUST00000216861 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm26205-201ENSMUST00000082907 134 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lrit1Q8K099 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lrit1Q8K099 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lrit1Q8K099 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lrit1Q8K099 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lrit1Q8K099 Gm6141-201ENSMUST00000117181 695 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lrit1Q8K099 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lrit1Q8K099 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Crygc-201ENSMUST00000027089 783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lrit1Q8K099 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lrit1Q8K099 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lrit1Q8K099 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrit1Q8K099 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrit1Q8K099 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrit1Q8K099 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrit1Q8K099 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrit1Q8K099 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrit1Q8K099 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrit1Q8K099 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrit1Q8K099 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrit1Q8K099 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrit1Q8K099 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrit1Q8K099 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrit1Q8K099 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrit1Q8K099 Phactr1-214ENSMUST00000149235 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrit1Q8K099 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrit1Q8K099 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Lrit1Q8K099 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrit1Q8K099 Gm11800-201ENSMUST00000120050 579 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrit1Q8K099 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Lrit1Q8K099 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Lrit1Q8K099 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrit1Q8K099 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrit1Q8K099 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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