Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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