Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Atxn7l1os1-201ENSMUST00000155877 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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