Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms