Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm5400-201ENSMUST00000118494 943 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Hsd17b13-203ENSMUST00000120320 1118 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Snrp1c-ps1-201ENSMUST00000205464 474 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm16131-201ENSMUST00000131007 659 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm26241-201ENSMUST00000174944 101 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm23976-201ENSMUST00000175001 101 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm22463-201ENSMUST00000175274 101 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm22547-201ENSMUST00000175281 101 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm22913-201ENSMUST00000175297 101 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm23282-201ENSMUST00000175306 101 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm25972-201ENSMUST00000175374 101 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm22414-201ENSMUST00000175466 101 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm26235-201ENSMUST00000175533 101 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm25084-201ENSMUST00000175556 101 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm24973-201ENSMUST00000175588 101 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm23292-201ENSMUST00000175618 101 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm23646-201ENSMUST00000178119 101 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm24643-201ENSMUST00000178305 101 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm24302-201ENSMUST00000178350 101 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm26386-201ENSMUST00000178407 101 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm25458-201ENSMUST00000178981 101 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm22825-201ENSMUST00000179444 101 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm44204-201ENSMUST00000204722 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Syna-201ENSMUST00000149604 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Myc-207ENSMUST00000188482 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm15351-202ENSMUST00000150686 271 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NischQ80TM9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Olfr281-201ENSMUST00000109163 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Vegfa-204ENSMUST00000113520 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm7138-201ENSMUST00000167669 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm37819-201ENSMUST00000194626 1065 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 BC002189-201ENSMUST00000195674 598 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 AC163351.1-201ENSMUST00000225539 737 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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