Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp49Q6P9L4 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms