Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bhlha9Q5RJB0 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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