Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms