Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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