Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rnf149Q3U2C5 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Rnf149Q3U2C5 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Rnf149Q3U2C5 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rnf149Q3U2C5 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rnf149Q3U2C5 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Rnf149Q3U2C5 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Rnf149Q3U2C5 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Rnf149Q3U2C5 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rnf149Q3U2C5 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Rnf149Q3U2C5 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rnf149Q3U2C5 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Rnf149Q3U2C5 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rnf149Q3U2C5 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rnf149Q3U2C5 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rnf149Q3U2C5 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rnf149Q3U2C5 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rnf149Q3U2C5 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rnf149Q3U2C5 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rnf149Q3U2C5 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Rnf149Q3U2C5 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rnf149Q3U2C5 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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