Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms