Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms