Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm5910-201ENSMUST00000211819 1746 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 H2afb2-201ENSMUST00000118616 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm13056-201ENSMUST00000142429 564 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm21917-203ENSMUST00000180309 561 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 5031425E22Rik-203ENSMUST00000188328 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 6430531B16Rik-205ENSMUST00000210254 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 AC140209.1-203ENSMUST00000227412 1524 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm43340-201ENSMUST00000200448 1344 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Stard4-202ENSMUST00000118990 648 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 AC154669.1-201ENSMUST00000224405 482 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Ang2-202ENSMUST00000228835 896 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 1110017D15Rik-202ENSMUST00000095126 884 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm14407-201ENSMUST00000121260 447 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 E130114P18Rik-209ENSMUST00000186369 306 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm10318-201ENSMUST00000186874 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm28381-201ENSMUST00000188403 193 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Spaca5-201ENSMUST00000040437 640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Trex1-202ENSMUST00000112053 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm12529-201ENSMUST00000119529 268 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Pde7a-203ENSMUST00000121951 382 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm11827-201ENSMUST00000142297 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm2721-202ENSMUST00000222652 459 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Calhm1-201ENSMUST00000111813 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm7847-201ENSMUST00000151645 777 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Ube4bos2-201ENSMUST00000154000 317 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Spc25-209ENSMUST00000167875 1194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TrioQ0KL02 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms