Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms