Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Htr1a-201ENSMUST00000022235 4484 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Rrh-202ENSMUST00000171313 1759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Chat-201ENSMUST00000070125 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Acox2-201ENSMUST00000022271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gmeb2-201ENSMUST00000049032 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Ins2-202ENSMUST00000105930 583 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Cel-201ENSMUST00000028161 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Rpgr-205ENSMUST00000115533 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 B3gat1-205ENSMUST00000161115 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Mat1a-201ENSMUST00000047286 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Stk38l-202ENSMUST00000111644 2274 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Zfp677-201ENSMUST00000056107 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Irx2P81066 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Zfp94-202ENSMUST00000108436 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Arhgap27-201ENSMUST00000041385 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Pa2g4-201ENSMUST00000026425 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Pitrm1-201ENSMUST00000021611 3318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gm26710-201ENSMUST00000181265 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Olfr173-202ENSMUST00000206205 2778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Tcf4-201ENSMUST00000066717 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gpn1-201ENSMUST00000076949 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Btg1-201ENSMUST00000038377 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Rars-201ENSMUST00000018992 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Kctd19-201ENSMUST00000063071 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Nr1i3-208ENSMUST00000155126 2980 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Atxn1-202ENSMUST00000167708 3751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Armcx5-201ENSMUST00000096321 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Fbxo34-204ENSMUST00000165714 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Irx2P81066 4933432K03Rik-203ENSMUST00000206276 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Irx2P81066 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Irx2P81066 L3mbtl2-201ENSMUST00000023029 3487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Irx2P81066 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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