Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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