Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irf5P56477 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Irf5P56477 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irf5P56477 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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