Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CartptP56388 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CartptP56388 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CartptP56388 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CartptP56388 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CartptP56388 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms