Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Xpnpep3-201ENSMUST00000041609 3236 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sh3bp1P55194 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sh3bp1P55194 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sh3bp1P55194 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sh3bp1P55194 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Rmdn2-201ENSMUST00000040368 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sh3bp1P55194 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sh3bp1P55194 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sh3bp1P55194 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Sh3bp1P55194 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Sh3bp1P55194 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Sh3bp1P55194 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Sh3bp1P55194 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Sh3bp1P55194 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Sh3bp1P55194 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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