Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms