Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Atxn10P28658 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Atxn10P28658 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atxn10P28658 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Atxn10P28658 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms