Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ints5-203ENSMUST00000191089 568 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm15570-201ENSMUST00000122093 625 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms