Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Irf1P15314 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Irf1P15314 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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