Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms