Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Tgfb1P04202 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Tgfb1P04202 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Tgfb1P04202 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Tgfb1P04202 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Tgfb1P04202 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Tgfb1P04202 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Tgfb1P04202 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Tgfb1P04202 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Tgfb1P04202 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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