Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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