Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm11608-202ENSMUST00000153049 877 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm24180-201ENSMUST00000179961 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 1700029N11Rik-203ENSMUST00000220639 1092 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Ly6c1-206ENSMUST00000188845 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm12796-201ENSMUST00000131864 344 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm3355-201ENSMUST00000160079 487 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Gm3687-201ENSMUST00000161710 460 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc8E9PWG2 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms