Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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