Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Atp8b5A3FIN4 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Atp8b5A3FIN4 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Atp8b5A3FIN4 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Atp8b5A3FIN4 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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