Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hdac5Q9Z2V6 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Hdac5Q9Z2V6 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Hdac5Q9Z2V6 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Hdac5Q9Z2V6 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Hdac5Q9Z2V6 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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