Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Col5a3Q9JLI2 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Atp5h-208ENSMUST00000180072 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm10250-201ENSMUST00000090488 482 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Mgst2-201ENSMUST00000099106 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Col5a3Q9JLI2 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Col5a3Q9JLI2 Tmem29-201ENSMUST00000059256 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Col5a3Q9JLI2 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Col5a3Q9JLI2 Gm11959-201ENSMUST00000148655 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Col5a3Q9JLI2 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Col5a3Q9JLI2 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Anapc15-203ENSMUST00000098237 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 A730090N16Rik-201ENSMUST00000160137 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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