Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk3aQ9JKX8 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms