Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms