Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms