Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm12Q9D0R8 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms