Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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