Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rhobtb3Q9CTN4 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rhobtb3Q9CTN4 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rhobtb3Q9CTN4 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rhobtb3Q9CTN4 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms