Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp16Q99LG0 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp16Q99LG0 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp16Q99LG0 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp16Q99LG0 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp16Q99LG0 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp16Q99LG0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Usp16Q99LG0 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Usp16Q99LG0 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Usp16Q99LG0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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