Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Csnka2ipQ8CH19 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Csnka2ipQ8CH19 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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