Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
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Ercc8Q8CFD5 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ercc8Q8CFD5 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
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