Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8CC96 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8CC96 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8CC96 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8CC96 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8CC96 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8CC96 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8CC96 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8CC96 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8CC96 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8CC96 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8CC96 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8CC96 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8CC96 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8CC96 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8CC96 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q8CC96 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8CC96 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8CC96 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms