Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Htatsf1Q8BGC0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms