Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttbk1Q6PCN3 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ttbk1Q6PCN3 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ttbk1Q6PCN3 Gm2237-201ENSMUST00000112595 471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 1700030A11Rik-201ENSMUST00000125317 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ttbk1Q6PCN3 Ighv1-11-201ENSMUST00000191801 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ttbk1Q6PCN3 Apex1-201ENSMUST00000049411 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttbk1Q6PCN3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms