Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fam35aQ3UEN2 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam35aQ3UEN2 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms