Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms