Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Olfr533-201ENSMUST00000071755 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ntf3-203ENSMUST00000204542 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm16211-201ENSMUST00000147722 1620 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm38033-201ENSMUST00000192037 269 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm32856-202ENSMUST00000212180 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Serpinb6d-202ENSMUST00000221681 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox12Q04890 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms