Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 H2-DMb2-202ENSMUST00000171231 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm17120-201ENSMUST00000164734 743 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm7924-201ENSMUST00000203975 785 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm4996-201ENSMUST00000122042 784 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 1700063D05Rik-203ENSMUST00000191461 666 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 AC140426.1-201ENSMUST00000227933 459 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Cyp2b13-201ENSMUST00000005669 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gm32540-201ENSMUST00000207174 1872 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Apoo-201ENSMUST00000113895 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Sfta2-201ENSMUST00000171166 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 1700019D03Rik-206ENSMUST00000190831 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gm20186-203ENSMUST00000202542 741 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Pttg1-201ENSMUST00000020685 634 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Cryab-206ENSMUST00000217475 1117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms