Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tubg1P83887 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms