Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ErfP70459 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ErfP70459 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ErfP70459 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ErfP70459 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ErfP70459 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ErfP70459 Btn1a1-201ENSMUST00000041674 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ErfP70459 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ErfP70459 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ErfP70459 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ErfP70459 Fndc7-202ENSMUST00000102620 3477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ErfP70459 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ErfP70459 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ErfP70459 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ErfP70459 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ErfP70459 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ErfP70459 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ErfP70459 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ErfP70459 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ErfP70459 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ErfP70459 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ErfP70459 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms